新育成的品种或品系,在推广大面积生产之前,必须经过区域化试验。区域化试验中需要研究的主要因素有:
(1)品种效应:这是供试品种的产量和品质等的主效,属固定型;
(2)地点效应:这是地点间的土壤类型、耕作制度、管理方法等可以预知的环境差异的效应,一般亦属固定型;
(3)年份效应:这是不同年份的温度、雨量、日照天数、偶然性灾害等难以预知的环境差异的效应,一般属于随机型;
(4)品种×地点互作:这是品种对于可预知的环境差异是否具有特殊的适应性,一般属于固定型;
(5)品种×年份:这是品种对于难以预知的环境差异是否有特殊的适应性,一般属于随机型;
(6)品种×地点×年份互作:这是品种×地点的互作是否随难以预知的环境差异而有不同,一般属随机型。
广为应用的品种必须具有品种主效大而互作小,这种品种在可预知或难以预知的环境变异下,能通过其本身基因系统的调节,在较高水平上保持相对稳定。互作大的品种则只能供特定地区或特定气候条件下利用,不能广泛应用。
在R中,agricolae包中的AMMI()函数可对品种区域试验资料进行方差分析,通过从加性模型的残差中分离模型误差和干扰,提高估计的准确度,并且借助于双标图可以更直观地描述和分析基因型与环境互作模式,其一般的使用格式为:
AMMI(ENV,GEN,REP,Y,MSE=0,console=FALSE,PC=FALSE)
ENV:指定环境效应变量;
GEN:指定基因型变量;
REP:指定重复(区组)变量;
Y:指定响应变量或指标变量;
MSE:均方误差;
console:逻辑变量,缺省值为FALSE,若为TRUE则将展示全部分析结果,若为FALSE则不显示;
PC:逻辑变量,缺省值为FALSE,若为TRUE则将显示主成分分析,若为FALSE则不显示。